• فیسبوک
  • لینکډین
  • یوټیوب

1. اساسي پوهه (که تاسو غواړئ تجربه برخه وګورئ، مهرباني وکړئ مستقیم دویمې برخې ته انتقال کړئ)

د دودیز PCR د مشتق عکس العمل په توګه ، د ریښتیني وخت PCR په عمده توګه د PCR امپلیفیکیشن عکس العمل په هر دور کې د فلوروسینس سیګنال بدلون له لارې په ریښتیني وخت کې د امپلیفیکیشن محصول مقدار بدلوي ، او د ct ارزښت او معیاري وکر ترمینځ اړیکې له لارې د پیل شوي ټیمپلیټ مقدار تحلیل کوي.

د RT-PCR مشخص معلومات دياساسی کرښه, د فلوروسینس حداود Ct ارزښت.

اساسی کرښه د 3rd-15th دورې د فلوروسینس ارزښت بیس لاین (بیس لاین) دی ، کوم چې د اندازه کولو ځینې وختونه د غلطۍ له امله رامینځته کیږي.
حد ( حد): د فلوروسینس کشف حد ته اشاره کوي چې د امپلیفیکیشن وکر د اضطراري ودې په سیمه کې په مناسب موقعیت کې ټاکل شوي ، په عمومي ډول د بیس لاین معیاري انحراف 10 ځله.
د CT ارزښت: دا د PCR دورې شمیره ده کله چې په هر عکس العمل ټیوب کې د فلوروسینس ارزښت حد ته ورسیږي.
د Ct ارزښت د ابتدايي ټیمپلیټ مقدار سره متناسب دی.

 د siRNA in1 په اړه ځینې تجربې

د RT-PCR لپاره د لیبل کولو عام میتودونه:

طریقه ګټه نیمګړتیا د غوښتنلیک ساحه
SYBR شنهⅠ پراخه تطبیق، حساس، ارزانه او اسانه د پریمر اړتیاوې لوړې دي، د غیر مشخص بانډونو سره مخ دي دا د مختلفو هدفونو جینونو کمیتي تحلیل، د جین بیان په اړه څیړنې، او د ټرانسجنیک بیا جوړونکي څارویو او نباتاتو څیړنې لپاره مناسب دی.
تقمان ښه ځانګړتیا او لوړ تکرار وړتیا نرخ لوړ دی او یوازې د ځانګړو اهدافو لپاره مناسب دی. د رنځجن کشف، د مخدره توکو د مقاومت جین څیړنه، د مخدره توکو د اغیزمنتیا ارزونه، د جینیاتي ناروغیو تشخیص.
مالیکولر بیکون لوړ ځانګړتیا، فلوروسینس، ټیټ پس منظر بیه لوړه ده، دا یوازې د یو ځانګړي هدف لپاره مناسبه ده، ډیزاین ستونزمن دی، او بیه لوړه ده. د ځانګړي جین تحلیل، د SNP تحلیل

د siRNA in2 په اړه ځینې تجربې د siRNA in3 په اړه ځینې تجربې

2. تجربوي ګامونه

2.1 د تجربې ګروپ کولو په اړه- په ګروپ کې باید ډیری څاګانې وي، او بیولوژیکي تکرارونه باید وي.

خالي کنټرول په تجربو کې د حجرو د ودې حالت معلومولو لپاره کارول کیږي
منفي کنټرول siRNA (غیر مشخص siRNA ترتیب) د RNAi عمل ځانګړتیا ښکاره کړئ.siRNA ممکن د 200nM غلظت کې غیر مشخص فشار غبرګون رامینځته کړي.
د لیږد ریجنټ کنټرول حجرو ته د لیږدونکي ریجنټ زهرجنیت یا د هدف جین په بیان باندې تاثیر لرې کړئ
siRNA د هدف جین پروړاندې د هدف جین بیان ټیټ کړئ
⑤ (اختیاري) مثبت siRNA د تجربوي سیسټم او عملیاتي ستونزو د حل لپاره کارول کیږي
⑥ (اختیاري) د فلوروسینټ کنټرول siRNA د حجرو د لیږد موثریت د مایکروسکوپ سره لیدل کیدی شي

2.2 د پریمر ډیزاین اصول

پراخه شوې ټوټه اندازه په غوره توګه په 100-150bp کې
د پریمر اوږدوالی 18-25bp
د GC منځپانګه 30%-70%، په غوره توګه 45%-55%
د Tm ارزښت 58-60℃
ترتیب د دوامداره T/C څخه ډډه وکړئ؛A/G دوامداره
3 پای ترتیب د GC بډایه یا AT بډایه څخه ډډه وکړئ؛د ترمینل اساس په غوره توګه G یا C دی؛دا غوره ده چې د T څخه مخنیوی وشي
بشپړتیا د پرائمر دننه یا د دوه پرائمرونو ترمینځ د 3 څخه زیاتو اډو د تکمیلي ترتیبونو څخه ډډه وکړئ
ځانګړتیا د پریمر ځانګړتیا تصدیق کولو لپاره د چاودنې لټون وکاروئ

①SiRNA د ډولونو لپاره ځانګړی دی، او د مختلفو ډولونو ترتیب به توپیر ولري.

②SiRNA په یخ وچ شوي پوډر کې بسته شوي، کوم چې د خونې په حرارت کې د 2-4 اونیو لپاره په ثابت ډول ساتل کیدی شي.

2.3 وسیلې یا ریجنټونه چې باید مخکې له مخکې چمتو شي

پرائمر (داخلي حواله) په شمول دوه مخکی او شاته
پرائمر (د هدف جین) په شمول دوه مخکی او شاته
هدف Si RNA (3 پټې) عموما، شرکت به 3 پټې ترکیب کړي، او بیا به د RT-PCR لخوا له دریو څخه یوه غوره کړي
د لیږد کټ Lipo2000 etc.
د RNA چټک استخراج کټ د انتقال وروسته د RNA استخراج لپاره
د چټک ریورس لیږد کټ د cDNA ترکیب لپاره
د PCR امپلیفیکیشن کټ 2×سوپر SYBR شنه
د qPCR ماسټر مکس

2.4 د هغو مسلو په اړه چې باید په ځانګړو تجربوي مرحلو کې ورته پام وشي:

①siRNA د انتقال پروسه

1. د پلیټ کولو لپاره، تاسو کولی شئ 24 څاه پلیټ، 12 څاه پلیټ یا 6 څاه پلیټ غوره کړئ (د 24 څاه پلیټ په هر څاه کې د اوسط RNA غلظت وړاندیز شوی شاوخوا 100-300 ng/uL دی) او د حجرو غوره لیږد کثافت تر 60٪ یا 80٪ پورې دی.

2. د لیږد مرحلې او ځانګړي اړتیاوې په کلکه د لارښوونو سره سم دي.

3. د انتقال څخه وروسته، نمونې د 24-72 ساعتونو په اوږدو کې د mRNA کشف (RT-PCR) یا پروټین کشف لپاره په 48-96 ساعتونو کې راټول کیدی شي (WB)

② د RNA استخراج پروسه

1. د خارجي انزایمونو په واسطه د ککړتیا مخه نیسي.پدې کې په عمده ډول د ماسکونو او دستکشو اغوستل په کلکه شامل دي؛د تعقیم شوي پایپټ لارښوونو او EP ټیوبونو کارول؛هغه اوبه چې په تجربه کې کارول کیږي باید د RNase څخه پاک وي.

2. دا سپارښتنه کیږي چې د چټک استخراج په کټ کې وړاندیز شوي دوه ځله ترسره کړئ، کوم چې په حقیقت کې پاکوالی او حاصلات ښه کوي.

3. فاضله مایع باید د RNA کالم ته لاس ونلري.

③ د RNA اندازه کول

وروسته له دې چې RNA استخراج شي، دا په مستقیم ډول د Nanodrop سره اندازه کیدی شي، او لږترلږه لوستل کیدای شي د 10ng/ul په څیر ټیټ وي.

④ د نقل کولو پروسه ریورس کړئ

1. د RT-qPCR د لوړ حساسیت له امله، لږترلږه 3 موازي څاه ګانې باید د هرې نمونې لپاره جوړ شي ترڅو د راتلونکی Ct د ډیری توپیر څخه مخنیوی وشي یا د احصایوي تحلیل لپاره SD خورا لوی وي.

2. د ماسټر مخلوط په مکرر ډول کنګل او یخ مه کوئ.

3. هر ټیوب/سوري باید د نوي ټیپ سره بدل شي!د نمونو اضافه کولو لپاره په دوامداره توګه ورته پایپټ ټیپ مه کاروئ!

4. د نمونې له اضافه کولو وروسته د 96 څاه پلیټ سره تړل شوی فلم باید د پلیټ سره نرم شي.دا غوره ده چې مخکې له دې چې په ماشین کې یې واچوئ سینټرفیوج کړئ، ترڅو د ټیوب دیوال کې مایع لاندې جریان وکړي او د هوا بلبلونه لرې کړي.

⑤عام منحنی تحلیل

د لوګاریتمیک ودې موده نه ده د نمونې احتمالي لوړ غلظت
د CT ارزښت نشته د فلوروسینټ سیګنالونو موندلو لپاره غلط ګامونه؛
د پرائمر یا پروبونو تخریب - د دې بشپړتیا د PAGE الیکٹروفورسیس لخوا کشف کیدی شي.
د نمونې کافي اندازه؛
د نمونو تخریب - د نمونې په چمتو کولو کې د ناپاکۍ معرفي کولو او بار بار یخولو او پړسوب څخه مخنیوی؛
Ct> 38 د ټیټ لوړولو موثریت؛د PCR محصول ډیر اوږد دی؛مختلف عکس العمل اجزا تخریب کیږي
خطي امپلیفیکیشن وکر پروبونه کیدای شي د یخ وهلو د مکرر یا د رڼا سره د اوږد مهاله تماس په واسطه په جزوي توګه تخریب شي
د نقل شوي سوراخونو توپیر په ځانګړې توګه لوی دی د عکس العمل محلول په بشپړه توګه نه دی منحل شوی یا د عکس العمل محلول مخلوط شوی نه دی؛د PCR وسیلې حرارتي حمام د فلوروسینټ موادو لخوا ککړ شوی

2.5 د معلوماتو تحلیل په اړه

د qPCR ډیټا تحلیل په نسبي مقدار او مطلق مقدار ویشل کیدی شي.د مثال په توګه، د درملنې ګروپ کې حجرې د کنټرول ګروپ کې د حجرو سره پرتله کیږي،

د ایکس جین mRNA څو ځله بدلیږي، دا نسبتا اندازه ده؛په یو ټاکلی شمیر حجرو کې، د ایکس جین mRNA

څومره نقلونه شتون لري، دا مطلق مقدار دی.معمولا هغه څه چې موږ یې په لابراتوار کې ډیر کاروو د نسبي کمیت میتود دی.معمولا،د 2-ΔΔct طریقهپه تجربو کې خورا کارول کیږي، نو یوازې دا طریقه به دلته په تفصیل سره معرفي شي.

2-ΔΔct میتود: ترلاسه شوې پایله د کنټرول ګروپ کې د هدف جین په پرتله په تجربوي ګروپ کې د هدف جین څرګندولو کې توپیر دی.دا اړینه ده چې د هدف جین او داخلي حوالې جین دواړه د لوړولو وړتیاوې 100٪ ته نږدې وي، او نسبي انحراف باید له 5٪ څخه ډیر نه وي.

د محاسبې طریقه په لاندې ډول ده:

Δct کنټرول ګروپ = په کنټرول ګروپ کې د هدف جین ct ارزښت - په کنټرول ګروپ کې د داخلي حوالې جین ct ارزښت

Δct تجرباتي ګروپ = په تجربوي ګروپ کې د هدف جین ct ارزښت - په تجربه لرونکي ګروپ کې د داخلي حوالې جین ct ارزښت

ΔΔct=Δct تجربوي ګروپ-Δct کنټرول ګروپ

په نهایت کې، د بیان په کچه کې د توپیر ګڼ شمیر محاسبه کړئ:

فولډ = 2-ΔΔct بدل کړئ (د ایکسل فنکشن سره مطابقت لري پاور دی)

اړوند توليدات:

د سیل مستقیم RT-qPCR کټ
د siRNA in4 په اړه ځینې تجربې


د پوسټ وخت: می-20-2023